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Species belonging to selected taxon:

Fragaria vesca



ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST000696
species: Fragaria vesca
miRNA family: MIR167
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Fragaria vesca Fragaria Potentilleae Rosodae Rosoideae Rosaceae Rosales fabids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
TGAAGCTGCCAGCATGATCTG

miRNA*
GGTCATTCTTGCAGCTTCAAA

mismatches: 2
bulges: 0

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pre-miRNA
GGTTTGTTTGGTTTGAGAGCTTGAAGCTGCCAGCATGATCTGGTACCACTAGAGACTAAACCTAGCTAGCTTGCTGTATAAATAGATCCGGAGAAGGTTG
AGTGTTGATTTTGTGTTTATGCCATGTATGTCCGTTTTGAGGTTTAGATATAAGAACTGCATCAAATAGATCGGTAAAAGATGCAGCTTGATATAGAAAT
AGGTATTCGAAATTTAGAATAGGATCCGGTTGGTGTTGATTTTGTGCTAGCTTATGTCCGGTGGCTTCAGGTTTAGATATAAGCTAGAACGGCGAAGAGA
TCGAATAGCAGAAGATCTAGATTTATGTAATTTGGTCCATACTTTTGATGGGGGTATTTTAGTTTTTGATAGATCTTGGTTTGTTTCATGTTCTGGGAAT
TCTGGAGAAATGGTTTTGAAGTCCACGAGTTCAGTTAAAGTTAAGTCTTAGATAAGTATATAAGGTTACTCTAGCTATACCAGGTCATTCTTGCAGCTTC
AAA
CACTCACTCACCAACAGT


dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase zma-MIR167i: 0.0000000005

PMRD zma-miR167i: 0.0000000005

microPC miR167: 0.00003
UniProt no hits

RFAM MIR167_1: 0.0000000005
most similar mature miRNAs

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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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